Com mais de 80% de seu território composto por Mata Atlântica protegida e preservada, Ubatuba se torna uma cidade importante para os turistas que buscam atividades de turismo ecológico. Um turismo Sustentável, respeitando a preservação do meio ambiente.
Este preservado trecho do litoral norte paulista tem uma característica intessante: é um dos raros pontos no Brasil onde a Mata Atlântica preservada encontra o Oceano Atlântico, criando um meio ambiente ímpar.

A Mata Atlântica propicia aos praticantes de Ecoturismo e Turismo de Aventura diversas trilhas em Ubatuba, desde as que são indicadas para pessoas de qualquer idade, numa atividade de contemplação da Natureza, até as trilhas que são verdadeiras aventuras e que só devem ser feitas na presença de monitores de ecoturismo especializados e experientes e por pessoas com bom preparo físico.

Outra atividade muito ligada a um litoral sustentável é a Observação de Pássaros (birdwatching). Ubatuba abriga uma das maiores diversidades de aves do mundo, e já é muito procurada pelos praticantes deste hobbie.

E em se falando de preservação, a cidade de Ubatuba também tem uma base do Projeto Tamar. A base faz o monitoramento da captura incidental de tartarugas marinhas nas redes e nos cercos flutuantes. Equipes do Projeto atendem os chamados dos pescadores para marcar e soltar os animais capturados, além de ensinar as técnicas para reanimar as tartarugas que estejam afogadas– presas na rede, não conseguem subir à superfície para respirar.